基礎醫學網絡信息資源整合及應用論文
基礎醫學在醫藥衛生領域起著舉足輕重的作用。多年以來,我國基礎醫學研宄在疑難病癥的病因、病理、病程發展等方面取得了卓有成效的成果⑴。基礎醫學研宄離不開信息資源的支持。目前網絡中積累的基礎醫學資源主要包括人體生理心理相關數據、基因序列、蛋白質圖譜、可視人體圖像等。歐美一些發達國家醫學信息網絡化建設起步較早,資源的網絡化服務也比較成熟。像歐洲的EMBL、美國的NCBI、日本的DDBJ都建立了多個大型的基因數據庫和蛋白質結構數據庫,實現數據的同步交換和更新,成為基礎醫學研宄必需的資源獲取平臺。我國基礎醫學資源較為分散,主要存儲在不同的科研單位,多以小型專業數據庫的形式為用戶提供服務,有各自的訪問路徑和查詢接口,服務方式和資源類型都較為單一。如何在這些來源廣泛、類型不同的資源之間建立聯系,滿足用戶全面的資源獲取需求,提高資源的利用率和共享率,是我國基礎醫學研宄必須面對的一大問題[2]。目前,解決這一問題的方法是實現基礎醫學資源整合。

1資源整合的意義
1。1為科研工作提供便利
科研水平的進步和科研內容的豐富使基礎醫學研宄過程中對科學數據資源的需求不斷提高[4]。基礎醫學的研宄是多個學科的交叉和融合。通過整合基礎醫學資源,科研人員可以通過一次檢索獲取多個學科的相關信息,提高了他們的信息資源
①中國醫學科學院基礎醫學研究所,北京協和醫學院流行病與衛生統計學系
②中國醫學科學院基礎醫學研究所,北京協和醫學院網絡中心
③中國醫學科學院基礎醫學研究所,北京協和醫學院基礎學院病原生物學系分子寄生蟲實驗室北京100005*基金項目:科技部國家科技基礎條件平臺科學數據共享工程重大項目。
獲取能力。基礎醫學資源整合提高了現有數據資源的利用率,避免了科研的重復投資1。2為政府決策提供支持基礎醫學資源整合可以讓有關部門對我國基礎醫學科研現狀整體把握,能夠更為科學地判斷基礎醫學研宄熱點,實現科研資金的合理分配,提高科研效率。通過對整合資源的系統分析,能夠提高數據分析的質量[5],為我國政府衛生管理政策的制定
和衛生決策的實施提供更為有力的支持。
1。3加強基礎醫學資源管理
目前基礎醫學數據資源呈現電子化、網絡化、分布性、無序性等特點這給資源有效管理和合理調配帶來很大困難。通過資源整合可以有效地實現數據資源的統一管理,實現科研成就的傳承和利用。
2基礎醫學資源整合建設
近年來,我國政府極為重視科學數據共享,己經將其作為一項戰略選擇納入國家科技基礎條件平臺建設。基礎醫學科學數據共享網(http/pic/p>
2。1資源整合的實現
2。1。1資源來源:共享網自2004年正式投入建設并對外公開發布以來,本著“邊建設,邊服務”的原則,得到全國范圍內多家科研單位和高等院校的支持和響應。目前共享網共整合了來自清華大學、北京大學、中科院生物物理所、北京華大基因、中國醫學科學院、軍事醫學科學院等10多家單位的25個數據庫資源^根據數據內容的不同,共享網將整合的25個數據庫分為以下4類:1)人群調查及人體數據資源包括中國人生理常數數據庫、中國人心理狀況數據庫、中國數字化可視人體數據庫、中國人群亞健康現狀調查數據庫及中國婦女和兒童營養狀況數據庫、中國人群心血管健康研宄數據庫共6個^(2)分子機制類數據資源包括非編碼RNA數據庫、神經突觸數據庫、人類腫瘤相關抗原數據庫、人類肝臟蛋白質組表達譜數據庫、人類尿蛋白質數據庫等共13個數據庫。(3)模式生物類數據資源包括動物模型基因組數據庫、基因組多態性圖譜數據庫、模式生物基因組數據庫和轉錄因子數據庫4個^(4)實驗材料數據資源包括實驗細胞數據庫和遺傳工程小鼠品系基本表型數據庫。
2。1。2整合技術:共享網采用門戶技術(Portal)來實現資源整合。門戶是一個應用框架,它能將各種應用系統、數據資源集成到一個信息管理平臺上,并以統一的用戶界面提供服務。利用門戶中的內容管理系統(contentmanagementsystem,CMS)將各個數據庫整合到共享平臺中,為用戶提供一站式的資源瀏覽和檢索系統,避免了信息冗余和查詢重復,提高信息獲取效率。共享網對整合的數據資源采用Oracle數據庫進行管理,并用WindowsServer2003服務器對外提供服務。
2。2資源整合管理
資源整合的關鍵是把好數據質量關。為保證資源質量,共享網成立了專門的學術委員會,聘請國內基礎醫學領域的院士、專家擔任委員會成員,對申請加入共享網的數據資源從數據量、數據服務、數據質量、科研成果等多個方面嚴格審查,確保每個整合資源的科學性和實用性。
根據基礎醫學數據量大,數據類型多樣的特點,共享網對整合的數據資源采用元數據方式統一管理。元數據(metadata)是關于數據的數據,是描述、定位、檢索、利用、管理信息資源的結構化信息。利用元數據對基礎醫學信息資源進行開發和描述,統一定義各種數據資源的基本信息和功能,為用戶使用提供方便。
3資源整合中的問題及對策
3。1資源整合中存在的問題
3。1。1數據標準不統一:由于基礎醫學資源類型多樣,數據編碼和組織方式都差別較大,數據管理沒有統一的標準,為資源整合帶來了很大的麻煩。
3。1。2資源管理不規范:有些基礎醫學資源涉及到保密性或安全性等問題,沒有完善的管理辦法對其進行合理規劃,并且資源整合還面臨資源所有權、知識產權及個人隱私等問題,給資源整合帶來不便。
3。1。3多數單位配合積極性不高:目前我國科學數據共享相關政策和法律法規尚不完善,缺乏相應的補償機制和激勵機制,致使共享積極性不高,共享觀念淡薄。一些數據資源被視為個人或單位所有,使得長期積累的數據資源無法實現更高的科學價值。
3。1。4數據分類和編碼紊亂:基礎醫學研宄己經積累了大量的科學數據,但是這些科學數據資源缺乏系統化的歸納、層次化的標識和規范化的表達,缺乏統一的、可操作的資源調查、規劃、設計與描述,導致科學數據資源使用效率低。數據格式的不同導致描述和管理的差異,給資源整合帶來困難。
3。1。5復合型人才匱乏:基礎醫學資源整合需要具備掌握基礎醫學知識、軟件開發技術和資源管理方法的復合型人才。而目前從事資源整合工作的人員大多只具備單一領域的知識背景,難以實現明確的需求分析和充分的知識交流。
34解決方案
3。2。1做好資源規劃工作:為了促進共享網資源整合有計劃、
可持續發展,必須要加強領導和管理,統籌規劃基礎醫學各類資源的實質性整合,加速從信息孤島向實現信息高度共享和網絡互聯的模式轉換[8]。同時對網絡中基礎醫學資源進行追蹤考察,全程管理,確保基礎醫學資源整合的遠期效果[1]。
3。22制定標準和規范:標準化是實現資源共享的根本要求。沒有統一的標準,就不能實現真正意義上的資源共享[9]。在基礎醫學資源整合的同時,要從我國國情出發,建立一套符合我國資源現狀的、能夠與國際接軌的標準規范,指導共享網建設科學高效進行。
3。23制定相應的法規政策:根據我國資源整合面臨的實際困難,國家有關部門應該建立健全資源整合的法律法規,明確規定科學數據共享原則,界定數據共享范圍。同時建立相應的補償機制,出臺督促賞罰措施。只有這樣才能使科學數據共享有法可依,促進科學數據管理和共享,使其潛在的價值得以充分發揮[5]。
3。24做好數據分類和編碼:實現基礎醫學資源整合要加強數據分類的研宄,提高醫藥衛生數據資源的管理和共享程度[7]。
3。25培養多學科交叉的復合型人才:人才建設是保證資源整合建設長期發展的前提。因此在資源整合的過程中應該針對基礎醫學的專業性需求,培養一批優秀的跨學科人才,保證資源整合的技術創新性和服務全面性。
4小結
基礎醫學科學數據作為一種科研資源其價值只有廣泛傳播和使用才能更大程度地發揮。通過建立共享網實現資源的實質性優化整合和廣泛性互補共享[8],為廣大的基礎醫學工作者提供方便的信息獲取渠道,以科學的理念、合理的機制,使整合資源達到更高層次的完美結合[1]。共享網建設本著“物理上合理分布、層次分明,邏輯上高度統一、充分共享”的建設宗旨,力爭建立一個提供“健康一亞健康一疾病”的一體化健康信息服務,為健康管理、疾病預防、藥品研發和臨床診治提供全面支持的綜合性基礎醫學資源平臺。
【基礎醫學網絡信息資源整合及應用論文】相關文章:
網絡信息安全與防范論文05-23
網絡信息安全與防范論文11-05
網絡信息安全與防范論文[合集]05-25
計算機網絡應用論文10-26
[經典]計算機網絡應用論文10-09
計算機網絡應用論文05-17
計算機網絡及應用論文05-18
網絡信息安全與防范論文15篇(通用)05-24
網絡信息安全與防范論文精品15篇05-26
關于網絡信息安全問題及對策分析論文07-02