2003年6月，中國地質大學(武漢)從“環境問題已成為實現社會經濟可持續發展所必須解決的關鍵性問題”的認識高度出發，結臺自身人才培養特色和學科優勢，正式組建環境學院，以促進和加強本校環境學科的建設與發展。
環境學院下設水資源與水文地質系、環境科學與工程系、環境地質系、生物科學與技術系和教學實驗中心5個教學實體，同時也是生物地質與環境地質教育部重點實驗室、湖北省廢物地質處置與環境保護重點實驗室、科技部中匈聯合環境科學與健康實驗室、中國地質大學(武漢)環境工程研究院(下轄環境評價研究所、大氣物理和大氣環境研究所、環境地質研究所、生態環境研究所、水資源研究所等)、地下水與環境模擬中心等科學研究機構的主要掛靠單位。
學院秉承了學校悠久的辦學歷史和優良傳統，前身主體為1952年建立的原北京地質學院水文地質教研室(1993年更名為中國地質大學(武漢)水文地質與環境地質系)以及1975年建立的原武漢地質學院古生物教研室生物學教學組，已有半個多世紀的發展沿革。學院現有2個博士后流動站(含1個共建站)、1個一級學科博士點和1個一級學科碩士點，涵蓋5個博士點、7個碩士點以及4個本科專業。此外，學院還擁有3個工程碩士和高校教師碩士學位專業點，形成了從本科、碩士、博士到博士后，以及工程碩士等完整的人才培養體系。學院現有在編教職工80人，其中專任教師63人。在校本科生800余人，研究生300余人，留學生80余人。
學院突出地下水科學與工程的學科優勢，并向地表水、土壤、生物和大氣等學科領域拓展，在地質環境保護、地下水資源開發利用、水土污染防治與修復、固體廢物資源化等方面形成了優勢和特色。2003年以來，學院緊密結合國家目標和社會發展需要，先后承擔了160余項科研項且，包括國家自然科學基金項目19項，科技部支撐計劃和“863”課題5項，累計科研經費達4000余萬元。學院以科研項目為依托，解決了一批重大工程建設關鍵性技術難題，獲得10余項國家發明專利，發表三大檢索論文200多篇，出版學術專著10余部，教材12部。
學院開展了廣泛的學術交流與合作，多次主辦國際、國內學術會議，與國內外幾十所大學和研究機構建立了合作關系。
2l世紀人類對水資源、生態、環境的依賴與關注，為我院的發展提供了良好契機，我們將努力把我院建設成為水、生、氣、環等多學科協調發展、特色鮮明的研究型學院。