哈爾濱工業大學基礎學部成立于2003年。
從2003年秋季學期開始，學校將全校本科一年級學生集中在二校區，由基礎學部統一管理，采取教學工作和學生工作有機結合的方式，大力加強學生自然科學基礎和人文社會科學基礎教育，全面培養學生的思想道德修養和綜合能力，使學生順利完成從中學到大學的過渡，一年后學生再回到專業所在院系繼續學習。
學校黨政領導高度重視基礎學部的工作，并組織全校力量協同配合。
經過四年的實踐，這一模式已初見成效。基礎學部已經順利完成了03、04、05、06級學生的培養。目前正在準備07級新生的入學準備各項工作。
基礎學部工作指導思想
基礎教學部以“育人為本”和“德育為先”為工作理念，努力建立一支過硬的管理隊伍，營造滿足學生學習和發展需要的和諧育人氛圍，堅持“兩線合一、注重能力、奠定基礎” 的工作指導思想。
基礎學部注重教學工作和學生工作有機結合，以理想信念教育為核心，以班風學風考風建設和學生基礎道德文明建設特別是誠信教育為落腳點，引導學生樹立遠大理想和近期發展目標，做好科學的自我規劃，幫助新生完成好從高中到大學學習和生活的平穩過渡，在育人實踐的第一階段為全面提高學生的綜合素質和學生的成長成才打下堅實的基礎。
基礎學部始終堅持優化服務，提高質量，積極為學校構建“科學育人”體系進行有益探索，為學校人才培養和實現建設世界一流大學的宏偉目標貢獻力量。
基礎學部工作目標定位
基礎學部在一年的培養教育和管理過程中，努力實現如下工作目標：
強化“三個了解”，即讓了學生解學校、了解專業、了解培養過程；
完成“三個過渡”，即讓學生順利完成從高中小班授課到大學大班教學的過渡、從父母督學到獨立自主學習的過渡、從保姆式家庭生活到自立式集體生活的過渡；
實現“三個適應”，即讓學生到大學后能盡快做到心理適應、學習適應、生活適應；
培養“三自意識”，即培養學生的自我教育、自我管理、自我服務意識；
樹立正確“三觀”，即樹立正確的世界觀、人生觀、價值觀。
在學生黨建方面，站在培養接班人的戰略高度，全面落實“五早方針”，即早教育、早選苗、早培養、早發展、早起作用的工作方針，為哈工大學生黨建夯實基礎。
在教育管理中，優化服務，提高質量，做到“三個及時”，即及時了解、及時掌握、及時解決在教學管理和學生工作中出現的各種問題，順利完成學生交接的“軟著陸”。
基礎學部現行管理模式
基礎學部行政上等同于學校的二級學院，業務上接受教務處和學工處的指導。工作中，與教務處、學工處配合做好教學管理和學生工作，與任課院系配合保證教學工作順利進行，與專業配合做好學生專業思想教育和學生交接及平穩過渡，與其它部門配合做好服務與保障工作。