一、國家級重點學科
1、一級學科國家重點學科
(1)海洋科學：涵蓋物理海洋學、海洋化學、海洋生物學、海洋地質4個二級學科。
(2)水產學：涵蓋水產養殖、漁業資源、捕撈學3個二級學科。
2、二級學科國家重點學科：環境科學，水產品加工及貯藏工程。
3、國家重點培育學科：港口、海岸及近海工程。
二、山東省重點學科
水生生物學、藥物化學、船舶與海洋工程、環境工程、會計學、氣象學、地圖學與地理信息系統、海洋物理學(海洋信息探測與處理)、計算機應用技術、應用化學、地球探測與信息技術、遺傳學、計算數學、區域經濟學、外國語言學及應用語言學、中國現當代文學、環境與資源保護法學、社會學、金融學、防災減災工程及防護工程。