上海財經大學財經研究所成立于1984年12月28日。它是學校獨立研制、研究生學位教育與科學研究相結合的綜合科研機構。財經研究所是上海市人民政府發展研究中心常務理事單位，《中國經濟》期刊主辦單位。學校歷任分管領導葉孝理教授、談敏教授、叢樹海教授。歷任所主要領導金蔚祖教授、朱德林教授、孫海鳴教授以及老一輩經濟學家和管理學家胡寄窗教授、梅汝和教授、彭輝芳教授、印堃華教授等為財經研究所的發展奠定了良好的基礎。現任所長趙曉雷教授為國內知名經濟學家。
財經研究所現有碩士點六個，分別為區域經濟學、城市經濟與管理、國防經濟、能源經濟與環境政策、農業經濟與管理、林業經濟與管理，博士點四個，分別為區域經濟學、國防經濟、能源經濟與環境政策、農業經濟與管理。
財經研究所研究人員均來自于國內外各大名校，專職研究隊伍由具有博士學位及中高級職稱的專業教師組成，學科構成包括理論經濟學、應用經濟學、工商管理、農林經濟、管理科學與工程、公共管理等一級學科。教師擅長的語種有英語、俄語、韓語、日語、法語等，并與美、英、法、日、俄、韓等國及中國香港、臺灣地區有著比較親切的交流與合作。截至2010年底，財經研究所共有教職工30人，其中專職研究人員27人，正高級職稱的教師7人，副高級職稱的教師14人，具有博士學位者26人，中青年教師已成為所內主要的科研力量。