上海中醫藥大學是新中國誕生后國家首批建立的四所中醫藥高等院校之一，辦學50年長足發展，已形成本專科教育、研究生教育、留學生教育和成人教育等完整的高等中醫藥人才培養體系。繼續教育學院依托學校醫教研學科優勢和雄厚的師資力量舉辦各類成人教育，是我校成人教育的專職辦學部門和管理機構。下設辦公室、學歷教育中心、非學歷教育中心、拓展部。
辦公室在院長領導下，組織制定繼續教育學院工作計劃，負責協調院內各教務管理崗位教學安排以及與學校內外相關部門的協調工作。
成人高等學歷教育目前設有夜大學專科、本科、專升本層次的中醫學、中藥學、臨床醫學、護理學、保健按摩等專業；中藥學自學考試。
我校是中藥學專業（專科段、獨立本科段）的高等教育自學考試主考學校。
非學歷教育中心接受上海市衛生局、上海市食品藥品監督管理局、上海市人事局等部門的委托，承擔了繼續醫學教育和執（從）業藥師繼續教育的培訓工作。以及面向社會（中醫藥專業技術人員、廣大群眾和港澳臺同胞）舉辦多層次多形式的各類中醫藥職稱考試考前輔導班、成人高考輔導班、中醫中藥防病治病、保健養生知識普及和技能（崗位）培訓班。
拓展部負責協助學院領導擬定學院的年度發展計劃及中長期發展規劃、新項目開發以及學校系統國家級繼續教育項目組織申報等。