上海醫藥工業研究院1979年經國務院學位評定委員會批準具有6個藥學二級學科碩士學位授予權。1981年，醫工院成為全國首批同時具有博士、碩士學位授予權單位之一。2000年，被國務院批準為藥學一級學科博士學位授予單位。目前有藥物化學、藥劑學、生藥學、藥物分析學、微生物與生化藥學、藥理學、生物化工專業招收研究生。現設有藥學一級學科博士后流動站。
一、招生人數
我院2014年擬招收攻讀學術型碩士學位研究生65名左右，專業目錄中所列各專業招生人數(含統考生、免試推薦生)根據國家計劃下達數等具體情況可能會有所調整。
二、報考條件
1、凡熱愛祖國、遵紀守法、品德良好、能夠為社會主義現代化建設而勤奮學習、努力攀登科學高峰的應屆本科畢業生和歷屆本科畢業生均可報考(歷屆本科畢業生須在復試時提供大學本科畢業證書和學士學位證書原件)。
2、年齡一般不超過40周歲(1973年8月31日以后出生)。
3、身體狀況符合國家規定的體檢標準(同普通高等學校招生體檢工作指導意見)。
4、已獲碩士或博士學位的人員只準報考委托培養或自籌經費碩士生。