應用數學碩士點于2003年獲得碩士學位授權，應用數學碩士點于2006年獲得博士學位授權。應用數學是我校重點建設的學科。
應用數學專業具有雄厚的師資力量，有博士生導師5人，碩士生導師8人。該專業主要研究方向有偏微分方程及其應用、常微分方程及其應用、生物數學、微分方程與動力系統、應用代數等。研究的特色主要是：1)有一批學術造詣較深的中青年學科帶頭人，如高洪俊、崔景安和董玉君等，在國內外應用數學界有較大影響。2)有廣泛的國內外學術聯系，多次主辦大中型高層次國際國內學術會議，與國內外著名院校經常進行交流和互訪，其中，高洪俊、董玉君和崔景安等經常出訪美國、加拿大、歐洲、日本、巴西、新加坡和香港。3)陣容整齊，梯隊合理，科研成果顯著，一批年輕的博士正在成為這支隊伍的主力。4)方向齊全、覆蓋面廣。在非線性偏微分方程、常微分方程及其應用、生物數學和非線性泛函分析等方向都有很強的研究力量。 5)來承擔省部級以上科研項目20余項，其中國家自然科學基金6項，等等。每年發表高水平論文20余篇，。
主要專業課程有：微分流形，抽象代數，代數拓撲，偏微分方程，二階橢圓方程，非線性拋物方程，臨界點理論，泛函分析，常微分方程定性理論，非線性泛函分析，應用數學方法，非線性發展方程，生物數學，變分方法，應用抽象代數等。
畢業生可在科研部門、高等學校從事理論研究和教學工作;也可在金融行政部門、工商企業單位、工程單位從事應用研究。