上海理工大學從1978年開始招收研究生，是全國首批經國務院學位委員會批準有權授予碩士學位的高等院校之一。經過學校多年的努力，現已建設成為具有工、理、經、管、文、法等6大學科門類涵蓋24個一級學科的研究生培養體系，3個博士后科研工作流動站，5個一級學科博士學位授權點，35個二級學科（含自設）博士學位授權點，22個一級學科碩士點，86個二級學科碩士點，17個領域具有工程碩士學位授予權及工商管理（MBA）、公共管理（MPA）、工程管理、國際商務、翻譯專業學位授予權。
學校現有國家重點（培育）學科1個；上海市重點學科8個；機械工業部重點學科7個，上海市教委重點學科5個。
學校現有中國工程院院士6人（含雙聘），國家級教學名師1人，國務院學位委員會學科評議組成員3人，國家自然科學基金評審組成員3人，國家”863”計劃領域專家委員會專家1人，國家級有突出貢獻的中青年科技專家4人, 國家杰出青年基金獲得者1人，國家“百千萬人才工程”一、二層次入選者6人，新世紀百千萬人才工程國家級人選1人，全國優秀教師4人，“長江學者”2人，新世紀優秀人才支持計劃3人，上海市領軍人才3人，東方學者13人，上海市優秀學科帶頭人2人等。
學校現有在校研究生5300余人，其中博士生300余人。博士生指導教師85名，碩士生指導教師730余名。
上海理工大學研究生部（黨委研究生工作部、學科建設辦公室）現有工作人員15名，下設招生辦公室、培養辦公室、學位辦公室、綜合管理辦公室、學生工作辦公室、專業學位辦公室。